Elegida el 23 de noviembre 1894, y reelegida en varias ocasiones, fue Superiora General hasta su muerte, el 20 de febrero de 1929.
Vivencia de la Caridad en Epidemias y Guerras en su Generalato:
- Epidemias de Tifus en Aragón (1898-1899), en Cantavieja, Teruel (al llegar refugiados de Cuba) y en Calcena (Zaragoza). Dos hermanas mueren.
- Peste en Mérida, Venezuela (1900)
- Guerras en Venezuela: 1899 Revolución Restauradora a la que se oponía la Revolución Liberadora. Se vive una situación grave en el Hospital de Mérida.
Importancia de sus generalatos y acontecimientos importantes en ellos:
- Consolidación de la Formación de las Hermanas, con ayuda del P. Juan Buj, Director espiritual del Noviciado durante 39 años. Él recogió el espíritu congregacional y dio solidez teológica, nueva expresión y profundidad a nuestra espiritualidad centrada en la Eucaristía, el Sagrado Corazón de Jesús y el misterio de la Cruz, signos que expresan el amor de Dios hacia el ser humano.
- Gestiones para lograr la aprobación de la Congregación y las Constituciones. Consigue despolitizar, eclesializar y universalizar la Congregación (esto último, al publicarse el 1-3-1897 en la Gaceta de Madrid de la Real Orden de 9-11-1893 conseguida por M. Martina Balaguer que autorizaba la existencia legal de la Congregación en toda España)
- Aprobación de la Congregación por el Papa León XIII, pasando así a ser de Derecho Pontificio (14-1-1898)
- Aprobación de las Constituciones por S. Pío X el 11-3-1904, que se entregan a las Hermanas en el V Capítulo General Extraordinario el 22-10-1904.
- Unificación de costumbres y tradiciones y animación espiritual de las comunidades:
- Exhorta en sus visitas: “tened unión de corazones en el dulce Corazón de Jesús”.
- Reuniones de superioras tras Ejercicios Espirituales conjuntos con el Consejo General.
- Edición del primer libro de “Prácticas piadosas” en 1913.
- Construcción de la Casa General (Noviciado y Sede del Consejo General, 1902-1904)
- Recogida y transmisión del carisma y espíritu congregacional profunda vida interior, experiencia de Dios, a través la oración y la vivencia de su Presencia en el hacer y en los acontecimientos de cada día)
- Exaltación de los Fundadores:
- Celebración de los cien años del nacimiento de la Congregación (1904)
- Centenario de los Sitios de Zaragoza (1908-1909) y reconocimiento de María Ràfols y Juan Bonal como héroes de la caridad.
- Apertura de la Cripta del Hospital de Gracia donde estaban enterrados nuestros Fundadores (1922)
- Cambio de nombre de la calle de la Misericordia por M. María Ràfols (1923)
- Traslado de los restos de María Ràfols y Juan Bonal a la Casa General (1925).
- Publicación de la primera Biografía de María Ràfols (“Heroísmo y Santidad” escrita por el P. Calasanz Rabaza) y de la revista Congregacional “Manantial de Vida” (1926)
- Inicio del Proceso Ordinario Informativo para la beatificación y canonización de María Ràfols (1926)
- Compra del Molí d’en Rovira (terrenos y casita) donde nació María Ràfols (1928-1929)
- Apertura de 45 nuevas Fundaciones entre España (en Aragón, Cataluña, Madrid, Navarra, País Vasco, Valencia) y Venezuela.
- Acontecimientos en Venezuela:
- Problemas políticos en Venezuela de 1892 a 1900, llevaron a cerrar varias fundaciones y algunas Hermanas volvieron a España.
- Nacimiento de la Congregación de Hermanas de la Caridad de Santa Rosa de Lima (1900) fundada por tres Hermanas de la Caridad de Santa Ana venezolanas.
- Viaje de M. Pabla a Venezuela en 1907: Muere allí Hna. Jerónima Molleres, superiora del Hospital Clínico de Barcelona, que la acompañaba en la visita.