La instrucción del proceso diocesano de la Causa de Canonización del Padre Juan Bonal tiene lugar en la Archidiócesis de Zaragoza del 29 de junio de 1995 al 7 de diciembre de 1999.

El 13 de octubre de 2000, la Congregación para las Causas de los Santos otorga el decreto de validez de dicho Proceso.

Después de la preparación de la Positio, el 16 de septiembre de 2011 tuvo lugar el Congreso de Consultores Teólogos.

El 20 de noviembre de 2012 la Sesión Ordinaria de Cardenales y Obispos, dirigida por el Cardenal Angelo Amato, S.D.B., aprobó las virtudes heroicas y fama de Santidad del Siervo de Dios.

Un mes más tarde, el Santo Padre Benedicto XVI, recibió en Audiencia a dicho Cardenal. En el transcurso de la misma, el Papa autorizó a la Congregación a promulgar, entre otros, el DECRETO concerniente a las VIRTUDES HEROICAS del “Siervo de Dios Juan José Santiago Bonal Cortada, español, 1769-1829, sacerdote, fundador de la congregación de las Hermanas de la Caridad de Santa Ana”, que reconoce al Padre Juan como Venerable.